南方醫(yī)科大學(xué)是算名牌大學(xué)的，而且是廣東省高水平大學(xué)重點(diǎn)建設(shè)高校中唯一的醫(yī)學(xué)院校，校內(nèi)學(xué)科覆蓋醫(yī)學(xué)、理學(xué)、工學(xué)、文學(xué)、管理學(xué)、法學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)等7大學(xué)科門類。
南方醫(yī)科大學(xué)什么檔次南方醫(yī)科大學(xué)屬于國(guó)內(nèi)排名比較靠前的醫(yī)學(xué)院校，綜合實(shí)力處于國(guó)內(nèi)中上游水平，比很多985、211院校還要強(qiáng)。2017年第四輪學(xué)科評(píng)估，B+檔的學(xué)科有3個(gè)，分別是基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合；B檔的學(xué)科有4個(gè)，分別是生物醫(yī)學(xué)工程、臨床醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、護(hù)理學(xué)；C-檔的學(xué)科有2個(gè)，分別是中藥學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)。
南方醫(yī)科大學(xué)是廣東省高水平大學(xué)重點(diǎn)建設(shè)高校中唯一的醫(yī)學(xué)院校，也是全國(guó)首批、廣東省唯一一所"部委省"共建高校，全國(guó)首批開設(shè)八年制本碩博連讀臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)的8所高校之一，全國(guó)首批卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃試點(diǎn)高校。
南方醫(yī)科大學(xué)王牌專業(yè)國(guó)家級(jí)特色專業(yè)：臨床醫(yī)學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、護(hù)理學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、中醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)
廣東名牌專業(yè)：臨床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、中醫(yī)學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、中藥學(xué)
國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科：人體解剖與組織胚胎學(xué)、內(nèi)科學(xué)（消化系病）、 中西醫(yī)結(jié)合臨床
國(guó)家重點(diǎn)（培育）學(xué)科：病理學(xué)與病理生理學(xué)、外科學(xué)（骨外）
國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科：中醫(yī)內(nèi)科腎病學(xué)、中藥制劑學(xué)、中醫(yī)內(nèi)科腦病學(xué)、中藥藥理學(xué)、中醫(yī)痹病學(xué)
廣東省重點(diǎn)學(xué)科：神經(jīng)生物學(xué)、人體解剖與組織胚胎學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)、內(nèi)科學(xué)、影像醫(yī)學(xué)與核醫(yī)學(xué)、外科學(xué)、腫瘤學(xué)、軍事預(yù)防醫(yī)學(xué)、軍事預(yù)防醫(yī)學(xué)、藥理學(xué)