執業藥師注冊有效期是五年。按照《執業藥師職業資格制度》第十六條，新規要求執業藥師注冊證有效期從三年改為五年，需要延續的應在有效期屆滿三十日前，朝所在地區注冊管理機構提出延續注冊申請。
在哪個網站上可以辦理執業藥師注冊申請人員可以登上國家藥品監督管理局網上辦事大廳（網址：https://zwfw.nmpa.gov.cn/web/index），點擊標題欄中的其他，點擊全國執業藥師注冊管理信息系統中的在線辦理按鈕，辦理注冊。
第一次注冊執業藥師怎樣操作執業藥師第一次注冊主要有以下步驟：
1、進入“國家藥品監督管理局執業藥師注冊平臺（http: //zyys.nmpa.gov.cn）單擊網上申報按鈕；
2、在網上填寫自己的基本信息；
3、網上修改登陸密碼；
4、網上填寫申請表；
5、網上提交申報；
6、網上打印申請表；
7、攜帶審核材料到注冊機構進行審核步驟；
8、在網上查詢審核狀態；
9、網上注冊許可公示；
10、到注冊機構領取證書【去你注冊時選取的省份藥品監督管理局領取】。
在完成每一步時都應該確保信息的正確性，防止影響注冊結果。
要如何變更執業藥師注冊執業藥師變更注冊的方法是這樣的：申請人申請-注冊機構受理-審核-審批-制證-送達。申請人需要登錄“國家藥品監督管理局執業藥師注冊平臺”（http://zyys.nmpa.gov.cn）單擊“網上申報”，進入“國家藥品監督管理局網上辦事大廳”個人登錄頁面（https://zwfw.nmpa.gov.cn/web/user/login#person）登錄以后進行操作，或者直接登錄“國家藥品監督管理局網上辦事大廳”（https://zwfw.nmpa.gov.cn），依照具體的方法進行操作。申請變更注冊時，需將原注冊證寄回政務服務大廳，以免影響變更進度。具體的變更操作注意事項，以各省份的要求為準。
執業藥師再次注冊需要哪些資料執業藥師再次注冊所需材料如下所示：
1、《執業藥師資格證書》以及《執業藥師注冊證》；
2、執業單位考核材料；
3、《執業藥師繼續教育登記證書》；
4、縣級（含）以上醫院出具的本人6個月內的健康體檢表。
準備申請再次注冊前，需要先將這些資料準備完整，以免影響后續的環節進程。