執業藥師注冊有效期是五年。按照《執業藥師職業資格制度》第十六條，新規要求執業藥師注冊證有效期從三年更改為五年，需延續的應該在有效期屆滿三十日之前，朝所在地注冊管理機構提出延續注冊申請。
在哪一個平臺上能進行執業藥師注冊申請者可以登錄國家藥品監督管理局網上辦事大廳（網址：https://zwfw.nmpa.gov.cn/web/index），選擇標題欄上的其他，選擇全國執業藥師注冊管理信息系統中的在線辦理選項，進行注冊。
執業藥師初次注冊程序有哪些執業藥師第一次注冊主要有以下步驟：
1、進入“國家藥品監督管理局執業藥師注冊平臺（http: //zyys.nmpa.gov.cn）單擊網上申報欄目；
2、在線上填寫自己的基本信息；
3、網上修改登陸密碼；
4、網上填寫申請表；
5、網上提交注冊申請；
6、網上下載打印申請表；
7、攜帶審核材料到注冊機構進行審核流程；
8、在線上查詢審核狀態；
9、網上注冊許可公示；
10、到證書注冊機構領取證書【去你注冊時選擇的省份藥品監督管理局領取】。
在完成每一步時都需要確保信息的正確性，防止影響注冊結果。
執業藥師證書變更說明執業藥師如果是在相同的執業地區變更執業單位或是執業范圍的，須去原來的執業藥師注冊機構辦理變更注冊手續。
再次注冊執業藥師得滿足的條件都有哪些申請執業藥師資格再次注冊的人，須同時符合下面的條件：拿到《執業藥師資格證書》；遵紀守法，遵守藥師職業道德；身體健康，能堅守在執業藥師崗位工作；經所在單位考核同意；申請的人還必須要有參加執業藥師繼續教育的記錄。