執業西藥師屬于上崗證，初級藥師屬于技術職稱。執業西藥師和初級藥師的區別主要有以下幾點：

1.所屬系統不同

執業藥師由人事部和食品藥品局組織考試，屬于藥監系統；初級藥師由衛計委組織考試，屬于衛生系統。

2.報名網站不同

執業藥師在中國人事考試網報名；初級藥師在中國衛生人才網報名。

3.考試科目不同

執業藥師考試科目有：（中）藥學專業知識一、（中）藥學專業知識二、（中）藥學綜合知識與技能、藥事管理與法規；初級藥師考試科目有：基礎知識、相關專業知識、專業知識、專業實踐能力。

4.用途不同

執業藥師一般在藥店用，初級藥師一般是在醫院評職稱。

5.考試報名條件不同。