執業中醫師和執業中藥師能同時注冊，執業中醫師屬于衛生系統，執業中藥師屬于藥監系統，2個證分屬不同，是可以同時注冊的。
《醫師執業注冊暫行辦法》第六條指出：擬在醫療、保健機構中執業的人員，應當向批準該機構執業的衛生行政部門申請注冊。擬在預防機構中執業的人員，應當向該機構的同級衛生行政部門申請注冊。擬在機關、企業和事業單位的醫療機構中執業的人員，應當向核發該機構《醫療機構執業許可證》的衛生行政部門申請。
《執業藥師注冊管理辦法》第五條指出：執業中藥師只能在一個執業藥師注冊機構注冊，在一個執業單位按照注冊的執業類別、執業范圍執業。