副部級大學一共有31所，分別是：清華大學、北京大學、北京師范大學、中國人民大學、北京理工大學、北京航空航天大學、中國農業大學、復旦大學、上海交通大學、同濟大學、南開大學、天津大學、西安交通大學、西北工業大學、西北農林科技大學、南京大學、東南大學、武漢大學、華中科技大學、重慶大學、大連理工大學、吉林大學、山東大學、哈爾濱工業大學、中南大學、中國科學技術大學、廈門大學、中山大學、浙江大學、四川大學和蘭州大學。

材料補充：
副部級大學是中央直管高校的民間俗稱，簡稱中管高校，即中國共產黨中央委員會直接管理的高校。一般來講，中管高校的高層領導由中共中央、國務院聯合任命，而非由國家部委或省級人民政府任命。中管高校的黨委書記、校長職務均列入《中共中央管理的干部職務名稱表》，為中管干部。中管高校黨委書記、校長均為副部長級。

一般地，國內公立普通本科高校都是正廳級單位。其中一些高校由于自身實力得到中央認可，其黨委書記和校長高配為副部級，由中共中央直接管理。