醫學博士專業學位和學術學位的區別主要是：

1、培養目標不同：醫學博士專業學位是培養在醫學領域具有堅實的基礎理論能夠承擔專業技術或管理工作的專門人才，學術學位培養的是學術研究人才。

2、培養方式不同：醫學博士專業學位課程設置以實際應用為導向，以職業需求為目標，以綜合素養和應用知識與能力的提高為核心。學術學位的課程設置側重于加強基礎理論的學習，重點培養學生從事科學研究創新工作的能力和素質。

材料補充：

研究生學歷者申請臨床醫學專業學位流程及方法：

1、現行的臨床醫學研究生采取“分段連續培養、中期考核篩選、擇優進入第二階段、直接攻讀博士學位”的辦法培養。完成第一、第二階段培養者，可申請臨床醫學博士專業學位，完成第一階段培養但未升入第二階段者，經過一年臨床工作實踐，可申請臨床醫學碩士專業學位。

2、通過研究生培養的途徑獲得臨床醫學碩士學位者，自獲得學位后在相應專業從事臨床工作三年以上，經學位授予單位考核，認為其臨床工作能力達到授予臨床醫學博士專業學位要求的水平，可接受其在職申請臨床醫學博士專業學位。申請人可免于提交住院醫師規范化培訓證書，其它需提交的材料。