沈陽農業大學王牌專業有食品科學與工程、農學、園藝、林學、農林經濟管理、農業機械化及其自動化等，以下是具體名單，如有變動，以學校最新公布信息為準。
沈陽農業大學的王牌專業1、一流本科專業建設點（國家級+省級）
（1）2020年度國家級一流本科專業建設點名單：農業機械化及其自動化、食品質量與安全、植物保護、設施農業科學與工程、農業資源與環境、動物醫學、園林
（2）2020年度省級一流本科專業建設點名單：生物技術、電氣工程及其自動化、農業水利工程、動物科學
（3）2019年度國家級一流本科專業建設點名單：食品科學與工程、農學、園藝、林學、農林經濟管理（4）2019年度省級一流本科專業建設點名單：土木工程、農業機械化及其自動化、環境科學、植物保護、設施農業科學與工程、園林
2、國家特色專業：園藝、植物保護、農學、農業機械化及其自動化
3、國家級專業綜合改革試點專業：園藝
4、遼寧省普通高等學校示范性專業：園藝、植物保護、農學、農業機械化及其自動化專業、農業電氣化與自動化、動物科學
5、遼寧省首批一流本科教育示范專業：園藝、農學、食品科學與工程、植物保護、環境科學、農業機械化及其自動化、林學
6、遼寧省綜合改革試點專業：園藝、農學、農林經濟管理、動物科學、環境科學
沈陽農業大學優勢專業介紹電氣工程及其自動化專業：
本專業主要特點是強弱電結合、電工技術與電子技術相結合、軟件與硬件結合、元件與系統結合，學生受到電工電子、信息控制及計算機技術方面的基本訓練，具有解決電氣工程技術分析與控制技術問題的基本能力。
會計專業：
本專業培養具備管理、經濟、法律和會計學等方面的知識和能力，能在企、事業單位及政府部門從事會計實務以及教學、科研方面工作的工商管理學科高級專門人才。
金融學專業：
本專業學生主要學習貨幣銀行學、國際金融、證券、投資、保險等方面的基本理論和基本知識，受到相關業務的基本訓練，具有金融領域實際工作的基本能力。